Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RAB18Q9NP72 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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