Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00597Q9H2U6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms