Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM4Q9C037 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms