Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms