Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
IFT27Q9BW83 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms