Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RSG1Q9BU20 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms