Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms