Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRBNQ96SW2 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms