Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIPA1Q96FS4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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