Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ULK4Q96C45 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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