Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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HGDQ93099 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HGDQ93099 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HGDQ93099 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HGDQ93099 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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HGDQ93099 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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HGDQ93099 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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HGDQ93099 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HGDQ93099 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HGDQ93099 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HGDQ93099 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HGDQ93099 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HGDQ93099 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HGDQ93099 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HGDQ93099 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HGDQ93099 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HGDQ93099 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HGDQ93099 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HGDQ93099 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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