Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EDAQ92838 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDAQ92838 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDAQ92838 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDAQ92838 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDAQ92838 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDAQ92838 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EDAQ92838 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms