Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms