Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C17orf47Q8NEP4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C17orf47Q8NEP4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C17orf47Q8NEP4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C17orf47Q8NEP4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C17orf47Q8NEP4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C17orf47Q8NEP4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C17orf47Q8NEP4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C17orf47Q8NEP4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C17orf47Q8NEP4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C17orf47Q8NEP4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C17orf47Q8NEP4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms