Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF550Q7Z398 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF550Q7Z398 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF550Q7Z398 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ZNF550Q7Z398 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ZNF550Q7Z398 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ZNF550Q7Z398 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ZNF550Q7Z398 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ZNF550Q7Z398 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ZNF550Q7Z398 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ZNF550Q7Z398 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF550Q7Z398 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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