Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDZRN4Q6ZMN7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms