Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSTM1Q6UX27 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms