Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms