Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MLIPQ5VWP3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms