Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms