Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MSMPQ1L6U9 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MSMPQ1L6U9 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms