Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GEN1Q17RS7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
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