Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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