Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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NRF1Q16656 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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NRF1Q16656 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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