Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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