Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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