Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SHBQ15464 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SHBQ15464 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SHBQ15464 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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