Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AC005954.1-201ENST00000591962 337 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LAPTM4AQ15012 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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