Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNB1Q14721 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms