Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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