Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms