Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK13Q14004 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
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