Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
GTF2H3Q13889 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms