Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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