Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTCH1Q13635 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
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