Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
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CDH18Q13634 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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CDH18Q13634 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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CDH18Q13634 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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CDH18Q13634 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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