Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNASE1L3Q13609 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms