Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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NAE1Q13564 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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NAE1Q13564 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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NAE1Q13564 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NAE1Q13564 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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