Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
EIF4EBP1Q13541 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms