Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBB3Q13509 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TUBB3Q13509 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TUBB3Q13509 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TUBB3Q13509 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TUBB3Q13509 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TUBB3Q13509 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TUBB3Q13509 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TUBB3Q13509 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TUBB3Q13509 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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TUBB3Q13509 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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TUBB3Q13509 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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