Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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