Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
UBE2V1Q13404 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms