Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIK3Q13003 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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