Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BNIP3Q12983 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms