Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TFCP2Q12800 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFCP2Q12800 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms