Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNMA1Q12791 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNMA1Q12791 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms