Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRSF4Q08170 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms