Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms