Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DSG1Q02413 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DSG1Q02413 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms