Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

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Length 4,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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PKD1P98161 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKD1P98161 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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PKD1P98161 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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PKD1P98161 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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PKD1P98161 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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PKD1P98161 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
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PKD1P98161 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PKD1P98161 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
PKD1P98161 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
PKD1P98161 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PKD1P98161 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PKD1P98161 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PKD1P98161 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PKD1P98161 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PKD1P98161 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKD1P98161 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKD1P98161 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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